دوران لیگ برتر
همچنین ببینید: فصلهای باشگاه استقلال
اولین دوره
در این سال استقلال تا هفته پایانی در صدر جدول بود و تنها به یک مساوی در شهر انزلی و مقابل ملوان بندرانزلی نیاز داشت تا به قهرمانی برسد.اما با شکست در آن دیدار و هم زمان پیروزی تیم پرسپولیس تهران در شهر تهران ? تیم استقلال با تفاوت یک امتیاز و با ?? امتیاز به مقام نایب قهرمانی بسنده نمود. [?]
دومین دوره
در دومین دوره لیگ برتر که با قهرمانی تیم فوتبال سپاهان اصفهان به اتمام رسید?تیم استقلال تهران با مربیگری رولند کخ آلمانی به مقام نازل نهمی اکتفا کرد.در این دوره از مسابقات پاس و پیروزی به ترتیب دوم و سوم شدند.بر خلاف ادوار گذشته بازیهای استقلال و پرسپولیس در ورزشگاه تختی تهران که در شرق تهران است انجام میشد. [?]سومین دوره
در این دوره از مسابقات لیگ برتر که همزمان با آغاز مربیگری امیر قلعهنوعی در استقلال بود استقلال تا هفتههای پایانی در کورس قهرمانی قرار داشت اما در نهایت این تیم پاس بود که توانست قهرمانی را اذان خود کند و استقلال با ?? امتیاز دوم شد.در این دوره از مسابقات استقلال با ? باخت همراه با تیم قهرمان یعنی پاس کمترین باخت را داشت.بهترین گلزن استقلال نیز در این دوره رضا عنایتی با ?? گل بود.همچنین وی بیشترین پاس گل را نیز در این دوره از مسابقات با دادن ? پاس گل داد. [?]
چهارمین دوره
در این دوره از رقابتها استقلال تهران همچون دوره گذشته تا هفتههای پایانی در کورس قهرمانی قرار داشت ? اما در نهایت این تیم فولاد خوزستان بود که توانست به مقام قهرمانی برسد و استقلال تهران با ?? امتیاز و با تفاضل گل کمتر نسبت به تیم ذوب آهن اصفهان به مقام سوم رسید.در این دوره از مسابقات استقلال با زدن ?? گل زده بهترین خط حمله را داشت و رضا عنایتی با زدن ?? گل به آقای گلی رقابتها دست یافت.همچنین استقلال با تنها ? باخت همراه تیم قهرمان یعنی فولاد رکورد کمترین باخت را در بین تیمهای لیگ از آن خود نمود. [?]
پنجمین دوره
در این دوره استقلال به اولین قهرمانی خود در لیگ برتر با مربیگری امیر قلعه نوعی دست یافت.در این دوره از رقابتها تیم پاس رقیب استقلال تا هفتههای پایانی در رسیدن به قهرمانی بود.اما عاقبت تیم استقلال با ?? امتیاز و با پیروزی ? بر ? مقابل برق شیراز در بازی پایانی و در حضور ??? هزار تماشاگر در ورزشگاه آزادی به قهرمانی این دوره از رقابتها رسید.در این دوره از رقابتها رضا عنایتی با ?? گل که رکورد گل زنی در بازیهای لیگ است به مقام آقای گلی رسید.وحید طالبلو با مهار ? پنالتی بهترین پنالتی گیر و خط دفاعی استقلال به خوردن ?? گل بهترین خط دفاعی لیگ شد.همچنین تیم استقلال همراه با تیم پاس با بردن ?? بازی بیشترین برد را در این دوره از مسابقات داشتند.همچنین مجتبی جباری نیز به عنوان بهترین بازیکن لیگ انتخاب گردید. [?]
ششمین دوره
در این دوره از مسابقات که صمد مرفاوی مربیگری استقلال را بر عهده داشت ? استقلال مانند ادوار گذشته در کورس قهرمانی قرار داشت.اما این تیم سایپا بود که در نهایت توانست با مربیگری علی دایی بر سایر رفبا پیشی گرفته و به مقام قهرمانی برسد.تیم استقلال نیز در این دوره از رقابتها به مقام چهارمی رسید. [?]
هفتمین دوره
در هفتمین دوره از این رقابتها تیم استقلال با نتایج بسیار بدی روبرو گشت و به مقام پایین سیزدهمی رسید.در این رقابتها مربیگری استقلال تا نیمه فصل بر عهده ناصر حجازی و بعد از آن بر عهده فیروز کریمی بود. قهرمان این دوره تا بازی پایانی میان سپاهان و پرسپولیس مشخص نبود و در حالی که سپاهان به یک مساوی نیاز داشت، تیم سرخپوش توانست با به ثمر رساندن گل برتری در دقیقه ?? به مقام قهرمانی این دوره از رقابتها برسد.